Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSG1Q9BU20 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms