Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MXRA8Q9BRK3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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