Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3CQ99985 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3CQ99985 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3CQ99985 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms