Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms