Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAPLN3Q96S86 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms