Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPM1MQ96MI6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1MQ96MI6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1MQ96MI6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms