Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD8Q96LT4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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