Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SENP8Q96LD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms