Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNERQ8NFT8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNERQ8NFT8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DNERQ8NFT8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNERQ8NFT8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNERQ8NFT8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNERQ8NFT8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNERQ8NFT8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNERQ8NFT8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms