Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC82Q8N4S0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms