Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J8

UBE3D, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3DQ7Z6J8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3DQ7Z6J8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms