Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMIGD1Q6UXZ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMIGD1Q6UXZ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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