Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZM63

ETDB, Embryonic testis differentiation homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETDBQ3ZM63 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms