Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ME3Q16798 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME3Q16798 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME3Q16798 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME3Q16798 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME3Q16798 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME3Q16798 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME3Q16798 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME3Q16798 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME3Q16798 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME3Q16798 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME3Q16798 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME3Q16798 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME3Q16798 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME3Q16798 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME3Q16798 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME3Q16798 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME3Q16798 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME3Q16798 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME3Q16798 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME3Q16798 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME3Q16798 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME3Q16798 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME3Q16798 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME3Q16798 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME3Q16798 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME3Q16798 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME3Q16798 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ME3Q16798 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME3Q16798 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME3Q16798 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME3Q16798 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME3Q16798 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME3Q16798 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME3Q16798 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME3Q16798 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME3Q16798 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME3Q16798 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME3Q16798 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME3Q16798 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME3Q16798 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ME3Q16798 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME3Q16798 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME3Q16798 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME3Q16798 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ME3Q16798 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ME3Q16798 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ME3Q16798 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ME3Q16798 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ME3Q16798 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME3Q16798 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME3Q16798 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME3Q16798 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME3Q16798 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME3Q16798 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME3Q16798 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME3Q16798 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME3Q16798 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME3Q16798 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME3Q16798 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME3Q16798 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME3Q16798 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME3Q16798 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME3Q16798 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME3Q16798 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME3Q16798 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME3Q16798 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ME3Q16798 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ME3Q16798 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ME3Q16798 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ME3Q16798 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ME3Q16798 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ME3Q16798 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME3Q16798 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME3Q16798 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME3Q16798 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME3Q16798 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME3Q16798 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME3Q16798 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME3Q16798 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME3Q16798 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME3Q16798 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME3Q16798 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME3Q16798 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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