Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN3Q16667 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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