Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
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