Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHC1P78364 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHC1P78364 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHC1P78364 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHC1P78364 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHC1P78364 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC1P78364 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC1P78364 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC1P78364 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC1P78364 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC1P78364 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC1P78364 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC1P78364 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHC1P78364 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC1P78364 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC1P78364 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC1P78364 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC1P78364 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHC1P78364 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHC1P78364 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHC1P78364 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms