Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIF1P55008 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIF1P55008 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIF1P55008 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIF1P55008 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIF1P55008 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIF1P55008 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIF1P55008 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIF1P55008 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIF1P55008 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIF1P55008 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AIF1P55008 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIF1P55008 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIF1P55008 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIF1P55008 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIF1P55008 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIF1P55008 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIF1P55008 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIF1P55008 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIF1P55008 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIF1P55008 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIF1P55008 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIF1P55008 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIF1P55008 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIF1P55008 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIF1P55008 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIF1P55008 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIF1P55008 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIF1P55008 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIF1P55008 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AIF1P55008 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIF1P55008 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIF1P55008 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIF1P55008 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIF1P55008 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIF1P55008 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIF1P55008 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIF1P55008 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AIF1P55008 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIF1P55008 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIF1P55008 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIF1P55008 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AIF1P55008 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AIF1P55008 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AIF1P55008 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AIF1P55008 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AIF1P55008 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AIF1P55008 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AIF1P55008 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AIF1P55008 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AIF1P55008 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AIF1P55008 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AIF1P55008 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AIF1P55008 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AIF1P55008 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AIF1P55008 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AIF1P55008 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AIF1P55008 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AIF1P55008 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AIF1P55008 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIF1P55008 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AIF1P55008 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIF1P55008 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIF1P55008 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIF1P55008 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms