Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC1A2P43004 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms