Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN7P41732 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN7P41732 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms