Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARSP41250 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARSP41250 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARSP41250 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARSP41250 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARSP41250 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARSP41250 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARSP41250 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARSP41250 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GARSP41250 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARSP41250 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GARSP41250 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GARSP41250 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GARSP41250 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GARSP41250 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GARSP41250 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GARSP41250 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GARSP41250 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GARSP41250 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GARSP41250 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARSP41250 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARSP41250 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARSP41250 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARSP41250 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GARSP41250 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARSP41250 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARSP41250 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARSP41250 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARSP41250 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARSP41250 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARSP41250 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms