Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF4A3P38919 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms