Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALRP27797 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALRP27797 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CALRP27797 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALRP27797 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALRP27797 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALRP27797 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALRP27797 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALRP27797 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALRP27797 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALRP27797 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALRP27797 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALRP27797 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALRP27797 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALRP27797 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALRP27797 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALRP27797 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALRP27797 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALRP27797 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALRP27797 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALRP27797 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALRP27797 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALRP27797 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALRP27797 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALRP27797 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALRP27797 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALRP27797 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALRP27797 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALRP27797 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALRP27797 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALRP27797 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALRP27797 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALRP27797 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALRP27797 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALRP27797 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALRP27797 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALRP27797 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms