Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLNP26678 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLNP26678 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLNP26678 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLNP26678 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLNP26678 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLNP26678 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms