Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX1P22670 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX1P22670 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX1P22670 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX1P22670 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX1P22670 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX1P22670 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX1P22670 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX1P22670 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX1P22670 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX1P22670 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX1P22670 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX1P22670 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX1P22670 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX1P22670 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX1P22670 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX1P22670 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX1P22670 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX1P22670 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX1P22670 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX1P22670 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX1P22670 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX1P22670 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX1P22670 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX1P22670 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX1P22670 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX1P22670 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX1P22670 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX1P22670 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX1P22670 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX1P22670 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX1P22670 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX1P22670 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX1P22670 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX1P22670 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX1P22670 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX1P22670 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX1P22670 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX1P22670 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX1P22670 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX1P22670 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX1P22670 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX1P22670 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX1P22670 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX1P22670 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX1P22670 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX1P22670 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX1P22670 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms