Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms