Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2P04141 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2P04141 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF2P04141 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF2P04141 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF2P04141 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF2P04141 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF2P04141 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF2P04141 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF2P04141 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF2P04141 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF2P04141 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF2P04141 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF2P04141 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF2P04141 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF2P04141 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF2P04141 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF2P04141 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF2P04141 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF2P04141 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF2P04141 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF2P04141 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF2P04141 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF2P04141 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF2P04141 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF2P04141 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF2P04141 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF2P04141 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF2P04141 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF2P04141 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF2P04141 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF2P04141 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF2P04141 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF2P04141 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF2P04141 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF2P04141 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF2P04141 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSF2P04141 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF2P04141 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF2P04141 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF2P04141 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF2P04141 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF2P04141 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF2P04141 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF2P04141 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF2P04141 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF2P04141 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF2P04141 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF2P04141 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF2P04141 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF2P04141 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF2P04141 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF2P04141 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF2P04141 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF2P04141 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF2P04141 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF2P04141 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF2P04141 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF2P04141 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.4 ms