Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASA4O43374 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASA4O43374 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASA4O43374 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASA4O43374 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASA4O43374 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASA4O43374 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASA4O43374 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASA4O43374 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASA4O43374 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASA4O43374 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASA4O43374 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASA4O43374 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASA4O43374 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASA4O43374 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASA4O43374 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASA4O43374 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASA4O43374 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASA4O43374 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASA4O43374 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASA4O43374 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASA4O43374 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASA4O43374 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RASA4O43374 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASA4O43374 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASA4O43374 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RASA4O43374 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RASA4O43374 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASA4O43374 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASA4O43374 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASA4O43374 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASA4O43374 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASA4O43374 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RASA4O43374 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RASA4O43374 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASA4O43374 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASA4O43374 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASA4O43374 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASA4O43374 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASA4O43374 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASA4O43374 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASA4O43374 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASA4O43374 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASA4O43374 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASA4O43374 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASA4O43374 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASA4O43374 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASA4O43374 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASA4O43374 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASA4O43374 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASA4O43374 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASA4O43374 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASA4O43374 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASA4O43374 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASA4O43374 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms