Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUSKO15146 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUSKO15146 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MUSKO15146 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUSKO15146 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUSKO15146 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUSKO15146 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUSKO15146 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MUSKO15146 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUSKO15146 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUSKO15146 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUSKO15146 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUSKO15146 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUSKO15146 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUSKO15146 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUSKO15146 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUSKO15146 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUSKO15146 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUSKO15146 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUSKO15146 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUSKO15146 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUSKO15146 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MUSKO15146 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUSKO15146 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUSKO15146 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUSKO15146 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUSKO15146 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUSKO15146 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MUSKO15146 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUSKO15146 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUSKO15146 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUSKO15146 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUSKO15146 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUSKO15146 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUSKO15146 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUSKO15146 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUSKO15146 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUSKO15146 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUSKO15146 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUSKO15146 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUSKO15146 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUSKO15146 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUSKO15146 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUSKO15146 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUSKO15146 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUSKO15146 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUSKO15146 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUSKO15146 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUSKO15146 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms