Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
N4BP3O15049 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms