Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms