Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms