Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 ZNF451-211ENST00000504603 561 ntTSL 53.55□□□□□ -1.848e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 MAP4K3-203ENST00000414968 558 ntTSL 43.46□□□□□ -1.868e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 PPP6R3-209ENST00000525421 830 ntTSL 53.4□□□□□ -1.878e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.878e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 C5orf24-205ENST00000507390 269 ntTSL 23.3□□□□□ -1.888e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 MAP4K3-213ENST00000497566 528 ntTSL 32.87□□□□□ -1.958e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.078e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 AKR1A1-207ENST00000475985 335 ntTSL 24.14□□□□□ -1.758e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 AKR1A1-206ENST00000475919 630 ntTSL 28.62□□□□□ -1.038e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 AKR1A1-210ENST00000487654 552 ntTSL 25.44□□□□□ -1.548e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 GATS-204ENST00000435519 1306 ntTSL 226.31■■□□□ 1.88e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 GATS-202ENST00000414739 2007 ntTSL 1 (best)26.26■■□□□ 1.798e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.678e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 GATS-211ENST00000543273 2840 ntTSL 1 (best)24.79■■□□□ 1.568e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.178e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 MVD-212ENST00000565842 285 ntTSL 320.87■□□□□ 0.931e-13■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 ARHGEF1-221ENST00000600387 2272 ntTSL 320.11■□□□□ 0.818e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 GATS-201ENST00000328453 3526 ntTSL 1 (best)19.75■□□□□ 0.758e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 KLC4-206ENST00000460283 550 ntTSL 418.55■□□□□ 0.568e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.488e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 MVD-204ENST00000562741 217 ntTSL 217.74■□□□□ 0.431e-13■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 OBSL1-209ENST00000465589 571 ntTSL 316.82■□□□□ 0.288e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 KLC4-217ENST00000481499 1465 ntTSL 416.36■□□□□ 0.218e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 OBSL1-212ENST00000491370 584 ntTSL 416.04■□□□□ 0.168e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 KLC4-218ENST00000481888 549 ntTSL 215.75■□□□□ 0.118e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 DNMT3A-208ENST00000466601 812 ntTSL 213.4□□□□□ -0.268e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 IRF9-204ENST00000559229 567 ntTSL 212.8□□□□□ -0.368e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 PKMYT1-212ENST00000574333 479 ntTSL 312.69□□□□□ -0.388e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 MVD-207ENST00000563463 543 ntTSL 312.62□□□□□ -0.391e-13■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 DNMT3A-214ENST00000491288 472 ntTSL 312.39□□□□□ -0.438e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 PKMYT1-217ENST00000575040 605 ntTSL 312.17□□□□□ -0.468e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 DNMT3A-211ENST00000474887 847 ntTSL 311.98□□□□□ -0.498e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 DNMT3A-207ENST00000461228 581 ntTSL 511.76□□□□□ -0.538e-6■□□□□ 8.5
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SF3A3Q12874 IRF9-210ENST00000560542 819 ntTSL 211.28□□□□□ -0.68e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 TNS3-204ENST00000428457 5070 ntTSL 1 (best)11.25□□□□□ -0.618e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 PKMYT1-215ENST00000574680 717 ntTSL 211.06□□□□□ -0.648e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 DDB2-207ENST00000614394 1088 ntTSL 210.86□□□□□ -0.678e-6■□□□□ 8.5
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SF3A3Q12874 CA5A-203ENST00000568801 506 ntTSL 28.8□□□□□ -18e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 RAD54L-203ENST00000459678 775 ntTSL 58.74□□□□□ -1.018e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 NEDD9-210ENST00000505589 571 ntTSL 28.41□□□□□ -1.068e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 GTF3C1-210ENST00000569394 566 ntTSL 38.28□□□□□ -1.088e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 DNMT3A-212ENST00000482935 519 ntTSL 57.92□□□□□ -1.148e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 GATS-208ENST00000445230 451 ntTSL 36.96□□□□□ -1.38e-6■□□□□ 8.5
SF3A3Q12874 SPG7-210ENST00000564409 717 ntTSL 312.77□□□□□ -0.379e-7■□□□□ 8.4
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SF3A3Q12874 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)24.49■■□□□ 1.513e-16■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.483e-16■□□□□ 8.4
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SF3A3Q12874 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.213e-16■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.243e-16■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 PANK2-203ENST00000464452 771 ntTSL 39.82□□□□□ -0.843e-16■□□□□ 8.4
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SF3A3Q12874 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.475e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 ANXA5-205ENST00000509648 1083 ntTSL 23.59□□□□□ -1.835e-6■□□□□ 8.4
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SF3A3Q12874 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.841e-7■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.61e-7■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 BRD2-216ENST00000581002 550 ntTSL 417.4■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 BRD2-217ENST00000584808 547 ntTSL 417.4■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 BRD2-215ENST00000580234 718 ntTSL 416.72■□□□□ 0.271e-7■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 RXRB-205ENST00000483821 582 ntTSL 213.17□□□□□ -0.31e-7■□□□□ 8.4
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SF3A3Q12874 GSPT1-210ENST00000568849 790 ntTSL 311.88□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 RAPGEF5-208ENST00000471484 589 ntTSL 49.77□□□□□ -0.851e-7■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 FST-205ENST00000504226 705 ntTSL 38.91□□□□□ -0.981e-7■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.141e-7■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 FST-204ENST00000497789 712 ntTSL 26.11□□□□□ -1.431e-7■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 221.26■□□□□ 0.992e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 PLXND1-204ENST00000504524 1701 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 STARD7-202ENST00000443962 742 ntTSL 516.87■□□□□ 0.292e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 GOLGA3-205ENST00000537317 298 ntTSL 311.77□□□□□ -0.532e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.692e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 TBL1X-208ENST00000452824 387 ntTSL 510.36□□□□□ -0.752e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 PLXND1-211ENST00000506979 691 ntTSL 58.39□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 STARD7-206ENST00000495687 274 ntTSL 37.47□□□□□ -1.212e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 BIRC6-209ENST00000471232 4226 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 PLXND1-212ENST00000508630 563 ntTSL 26.4□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 56.34□□□□□ -1.392e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 SRC-209ENST00000489153 551 ntTSL 35.4□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 FBXO11-210ENST00000493962 1986 ntTSL 25.16□□□□□ -1.582e-6■□□□□ 8.4
SF3A3Q12874 HNRNPUL2-202ENST00000540127 439 ntTSL 34.5□□□□□ -1.692e-6■□□□□ 8.4
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