Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DTX4Q9Y2E6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DTX4Q9Y2E6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms