Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRPF3Q9ULD4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF3Q9ULD4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms