Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TNIKQ9UKE5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
TNIKQ9UKE5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TNIKQ9UKE5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms