Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CGGBP1Q9UFW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CGGBP1Q9UFW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CGGBP1Q9UFW8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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