Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BSDC1Q9NW68 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BSDC1Q9NW68 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms