Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms