Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UPF3BQ9BZI7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms