Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNPPD1Q9BV87 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNPPD1Q9BV87 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNPPD1Q9BV87 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNPPD1Q9BV87 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNPPD1Q9BV87 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNPPD1Q9BV87 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNPPD1Q9BV87 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNPPD1Q9BV87 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNPPD1Q9BV87 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms