Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GORASP1Q9BQQ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms