Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SGIP1Q9BQI5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGIP1Q9BQI5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms