Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC35A4Q96G79 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC35A4Q96G79 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms