Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TSR2Q969E8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSR2Q969E8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR2Q969E8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms