Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP33Q8TEY7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms