Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNERQ8NFT8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNERQ8NFT8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNERQ8NFT8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms