Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C5orf17Q8NAS9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf17Q8NAS9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms