Protein–RNA interactions for Protein: Q86SI9

C5orf38, Protein CEI, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf38Q86SI9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf38Q86SI9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf38Q86SI9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms