Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZM63

ETDB, Embryonic testis differentiation homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETDBQ3ZM63 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETDBQ3ZM63 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETDBQ3ZM63 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms