Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX2Q3B8N5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms